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新華醫(yī)院小兒外科是國家教育部985和211兒科學(xué)重點(diǎn)建設(shè)項(xiàng)目之一，也是全國唯一的衛(wèi)生部小兒結(jié)石病診療中心，是上海市臨床醫(yī)學(xué)中心建設(shè)項(xiàng)目(2002-2007年)。經(jīng)多年建設(shè)，2012年入選上海市臨床醫(yī)學(xué)中心重中之重（A類）學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目。小兒外科擁有床位204張，醫(yī)師 56 人，主任醫(yī)師13名，副研究員3名，副主任醫(yī)師 14名。本學(xué)科現(xiàn)有博士生導(dǎo)師6人，碩士生導(dǎo)師10人。

學(xué)科現(xiàn)有普外、新生兒、腫瘤、泌尿、神經(jīng)、骨科、心胸外科等專業(yè)，都有獨(dú)立病區(qū)，在診療規(guī)模和診療技術(shù)上處于國內(nèi)領(lǐng)先水平。小兒微創(chuàng)外科和小兒骨科是上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院小兒微創(chuàng)診治中心及髖關(guān)節(jié)發(fā)育不良和脫位診治中心。通過引進(jìn)和培養(yǎng)相結(jié)合的原則，形成了結(jié)構(gòu)較合理的亞?？迫瞬盘蓐?duì)，中青年骨干實(shí)力，潛力巨大。近年來本學(xué)科在臨床治療技術(shù)上已形成如下特色：1. 危重兒圍手術(shù)期營養(yǎng)支持技術(shù)，該技術(shù)開展與推廣已有25年，獲得國家科技進(jìn)步二等獎和上海市科學(xué)技術(shù)一等獎，尤其在新生兒短腸綜合征的治療方面有所突破；2. 新生兒先天性畸形早期干預(yù)，在國內(nèi)率先提出產(chǎn)房外科治療概念、開展產(chǎn)房外科手術(shù)；3.建立了多學(xué)科參與的兒童實(shí)體腫瘤個體化綜合治療模式，是國內(nèi)兒童實(shí)體腫瘤的臨床診治中心之一；4. 規(guī)范并推廣小兒微創(chuàng)技術(shù)在各亞專業(yè)的應(yīng)用，是國內(nèi)腔鏡手術(shù)應(yīng)用范圍最廣的單位之一；5. 建立了兒童泌尿系統(tǒng)結(jié)石微創(chuàng)處理體系,在兒童泌尿系統(tǒng)結(jié)石領(lǐng)域具有重要影響；6. 系統(tǒng)性建立了發(fā)育性髖關(guān)節(jié)發(fā)育不良和脫位的早期篩查、早期診斷、早期干預(yù)的診治體系；7.復(fù)雜先心病的早期診斷和治療。未來五年本學(xué)科將以上述方向?yàn)橹攸c(diǎn)建設(shè)目標(biāo)爭取成為國內(nèi)領(lǐng)先，部分項(xiàng)目國際先進(jìn)。成為醫(yī)療服務(wù)輻射更廣，質(zhì)量更高，人才隊(duì)伍齊全，特色鮮明的重點(diǎn)?？?/p>

2014年3月小兒外科大樓正式啟用，使小兒外科整體醫(yī)療環(huán)境有了長足的進(jìn)步，求醫(yī)范圍來自全國各省市及部分海外患兒，占求醫(yī)人數(shù)的60%-70%。

本學(xué)科共承擔(dān)973、863、衛(wèi)生部十二五重大攻關(guān)項(xiàng)目子課題，國家自然科學(xué)基金等國家級項(xiàng)目10項(xiàng)，省部級項(xiàng)目8項(xiàng)，榮獲國家科技進(jìn)步二等獎 1項(xiàng)，省部級獎7項(xiàng)。發(fā)表論著127篇，SCI論文28篇，主編教材1部，專著4部，獲得15項(xiàng)專利。本學(xué)科學(xué)術(shù)影響力不斷擴(kuò)大，每年主辦全國性會議1次 ,論壇、研討會5次,舉辦8項(xiàng)國家級繼續(xù)教育學(xué)習(xí)班，接收全國進(jìn)修26人次/年，來自于全國十多個省市自治區(qū)。